Īpašie konteineri ietver, bet ne tikai, šādus veidus:
Refrižeratorkonteiners: paredzēts saldētu vai zemas temperatūras preču pārvadāšanai, kurām nepieciešama noteikta temperatūra, piemērota gaļas, augļu un citu preču iekraušanai. Refrižeratorkonteineriem ir izolētas sienas, durvis, apakšas un augšas, kas var novērst siltuma apmaiņu starp iekšpusi un ārpusi. Tos iedala iekšējos mehāniskajos dzesēšanas konteineros un ārējos mehāniskajos dzesēšanas konteineros.
Kleitu pakaramo konteiners: Speciāli izmantots drēbju pārvadāšanai, ar šķērsstieņiem un pakaramajiem iekšā, lai atvieglotu gatavu apģērbu pakarināmu transportēšanu.
Konteiners ar atvērtu augšpusi: nav stingras virsmas, audekla, plastmasas loksnes utt. kā nojume, piemērota preču iekraušanai, kuru augstums pārsniedz konteinera maksimālo augstuma ierobežojumu.
Plakans plaukts konteiners: konteiners bez augšējās un sānu sienām vai pat gala sienas, bet tikai ar apakšējo plāksni un četrām stūra kolonnām, kas piemērots īpaši augstu un īpaši platu preču, mājlopu un tukšu preču pārvadāšanai, kas ir atbrīvotas no ārējais iepakojums.
Tvertnes konteiners: īpaši paredzēts šķidru vai gāzveida preču, piemēram, spirta, benzīna, ķīmisko vielu utt., pārvadāšanai, kas sastāv no tvertnes un rāmja.
Augsts kubs: augstāki par standarta konteineri, ko parasti izmanto liela apjoma, bet ne pārāk smagām precēm, piemēram, vieglām precēm.
Plakans plaukts: bez fiksētām sienām un virsmām, piemērots lielizmēra vai pārāk augstām precēm, piemēram, lielām mašīnām un iekārtām, celtniecības materiāliem utt.
Atvērtā puse: ar papildu sānu durvīm tas ir ērts preču iekraušanai un izkraušanai no sāniem, parasti izmanto garām precēm vai precēm, kurām nepieciešama sānu piekļuve.
Bīstamo kravu konteiners: konteiners, kas īpaši paredzēts bīstamo kravu pārvadāšanai saskaņā ar starptautiskajiem bīstamo kravu pārvadāšanas noteikumiem.
Roll-on/Roll-off: izmanto transportlīdzekļu pārvadāšanai ar atvērtu vai pilnībā atveramu asti, lai atvieglotu transportlīdzekļa iekāpšanu un izkāpšanu.
